Nama SMA Negeri 6 Bengkulu Selatan, perlahan-lahan tapi pasti, akan memiliki popularitas yang sama dengan pada masa kini. Berdasarkan perjalanan waktu dan sejarah. Berdirinya SMA Negeri 6 Bengkulu Selatan pada tahun 1996/1997 mendapat sambutan yang sangat baik dari masyarakat kabupaten Bengkulu Selatan khususnya warga kecamatan Manna dan sekitarnya walaupun pada saat berdirinya belum memiliki gedung sekolah, pada masa itu kegiatan belajar mengajar (KBM) dilaksanakan di SMA Negeri 1 Bengkulu Selatan dengan waktu belajar sore hari.
Pada waktu awal SMA Negeri 6 Bengkulu Selatan mempunyai setatus vilial (kelas jauh) dari SMA Negeri 1 Manna yang sekarang berubah nama menjadi SMA Negeri 1 Bengkulu Selatan (SMANSA) ini terbukti pada awal tahun berdirinya, SMA Negeri 6 Bengkulu Selatan sudah memiliki satu ruang guru, satu ruang tata usaha dan satu ruang kepala sekolah serta tiga kelas rombongan belajar.
Kepala sekolah SMA Negeri 6 Bengkulu Selatan, yakni Bapak Darusman Alwi, S.Pd. yang sebelumnya menjabat sebagai wakil kepala sekolah bagian kurikulum SMAN 1 Manna pada akhir tahun pelajaran 1997/1998 lokasi mengajar untuk kelas X dan XI. Sedangkan untuk kelas XII menempati gedung SMA Negeri 1 Manna dengan waktu belajar sore hari.
Pada akhir tahun 1999 SMA Negeri 6 Bengkulu Selatan resmi terpisah dari SMA Negeri 1 Manna yang ditandai dengan diterbitkannya Nomor Induk Sekolah (NIS): 3012603 dan Nomor Statistik Sekolah (NSS): 301260304006 dengan NPSN: 10700972 dan sebagai kepala sekolah definitifnya adalah Bapak Darusman Alwi, S.Pd, seiring dengan itu status sekolah pun berubah bukan lagi vilial dari SMU Negeri 1 Manna melainkan 100% menjadi SMU Negeri 6 Bengkulu Selatan. Dalam perjalannya SMU Negeri 6 Bengkulu Selatan berubah menjadi SMA Negeri 6 Bengkulu Selatan.
Perkembangan SMA Negeri 6 Bengkulu Selatan terlihat pada dibangunnya ruangan kelas baru yang sampai saat ini telah mencapai 6 kelas belajar. Selain itu nama SMA Negeri 6 Bengkulu Selatan semakin harum terdengar bukan hanya di Kabupaten Selatan namun sudah mencapai keluar hingga tingkat Provinsi. Dan proses pembangunan terus berlanjut hingga pada tahun 2021/2022 terdiri dari 24 kelas rombongan belajar, angka ini cukup signifikan dalam dunia pendidikan untuk sekolah setingkat SMA Negeri 6 Bengkulu Selatan pada saat itu. Dalam perjalannanya SMA Negeri 6 Bengkulu Selatan telah mengalami beberapa kali pergantian kepemimpinan Kepala Sekolah diantaranya :
- Bapak Alwi Darusman, S.Pd ( Tahun 1998– Tahun 2004)
- Bapak Drs. Zakrinal, M.Pd ( Tahun 2004 – Tahun 2007 )
- Bapak Sutanto, M.Pd ( Tahun 2007 – Tahun 2009 )
- Bapak Pajaruddin, M.Pd ( Tahun 2009 – Tahun 2011 )
- Bapak Tarman Hayadi, M.Pd ( Tahun 2011 – Tahun 2016 )
- Ibu Sri Hartati, S.Pd ( Tahun 2016 – 2024 )
- Bapak Juharman, M.Pd.I (Tahun 2024 - Sekarang )
Kepala Sekolah Yang Pernah Menjabat di SMA Negeri 6 Bengkulu Selatan
Kebanggaan untuk sekolah bahwa sekolah mendapatkan bantuan berupa LAB IPA (Kimia dan Biologi) beserta isinya. Serta gedung laboratorium Kimia dan Biologi lengkap dengan fasilitas didalamnya. Masjid Raudhatul ‘Ulum yang megah serta memadai dan sarana olahraga yang berupa volley dan futsal standar nasional merupakan kebanggaan keluarga besar SMA Negeri 6 Bengkulu Selatan disamping telah meluluskan 100% kelas XII, tujuh kali berturut-turut.
Untuk menambah perfomance bagi sekolah Ibu Sri Hartati, S.Pd. merencanakan gerakan penghijauan lingkungan, ini terbukti pada tahun 2016/2017 SMA Negeri 6 Bengkulu Selatan terpilih sebagai sekolah berwawasan dan berbudaya lingkungan (green school) dan sekolah ADIWIYATA tingkat Provinsi Bengkulu, bahkan pagar muka sekolah dengan gapura didesain khusus agar memiliki khas Bengkulu, itu yang menambah rasa percaya diri yang tinggi dalam meningkatkan kinerja guna mewujudkan visi dan misi SMA Negeri 6 Bengkulu Selatan.